Работнікі універсітэта ўзнагароджваюцца за заслугі і дасягненні па развіцці і ўдасканаленні адукацыйнага працэсу, актыўную навукова-даследчую дзейнасць, значны ўклад у падрыхтоўку высокакваліфікаваных спецыялістаў і навукова-педагагічных кадраў, добрасумленнае і творчае выкананне сваіх працоўных абавязкаў. Студэнты універсітэта ўзнагароджваюцца за высокія акадэмічныя дасягненні, поспехі ў навуковай рабоце і актыўную грамадска-карысную дзейнасць.

Сваю самую высокую ўзнагароду - ордэн Працоўнага Чырвонага Сцяга Мінскі дзяржаўны медыцынскі інстытут атрымаў ў 1971 годзе за заслугі ў падрыхтоўцы медыцынскіх кадраў, за развіццё аховы здароўя і медыцынскай навукі.